Fakultas Komputer Universitas Universal memiliki struktur organisasi yang dirancang untuk mendukung pelaksanaan Tri Dharma Perguruan Tinggi secara efektif dan efisien.

Struktur ini terdiri dari pimpinan fakultas, departemen, unit pendukung, dan berbagai komite yang bekerja secara sinergis untuk mencapai visi dan misi fakultas.